Dentro de la estructura de la Administración General de la Universidad de Guadalajara, la Unidad de Innovación, Calidad y Ambientes de Aprendizaje es una dependencia de la Coordinación de Desarrollo Académico, donde se realizan procesos relacionados con la evaluación y acreditación de los Programas Educativos de pregrado.
En la Red Universitaria, el pregrado comprende la formación de licenciatura, técnico superior universitario y nivelaciones a licenciatura. En este sentido, el objetivo es formar profesionistas con las habilidades que demanda el campo laboral y que tengan las capacidades mínimas necesarias para continuar con su formación en estudios de posgrado o especialidad, según corresponda. Por lo anterior, se requiere que el alumno adquiera habilidades propias de la disciplina, pero también habilidades profesionales transversales, que le permitan incorporarse de manera productiva en la sociedad. La Unidad de Aprendizaje e Innovación es la encargada del seguimiento de dos procesos fundamentales en la Red Universitaria: La acreditación de los Programas Educativos y la evaluación de los conocimientos de los egresados.
Los procesos de evaluación forman parte de los indicadores de calidad de los Programas Educativos, cuando uno de ellos obtiene una evaluación satisfactoria por parte de alguno de los organismos acreditadores avalados por la SEP, se le otorga un reconocimiento de calidad, a través de una constancia de acreditación, que tienen vigencia por periodos determinados. Para realizar los procesos de evaluación y acreditación, se cuenta con diversos organismos nacionales e internacionales. En el ámbito nacional, las dos entidades a las que ha recurrido la Institución es el Consejo Para La Acreditación De La Educación Superior A.C. (COPAES) y los Comités Interinstitucionales para la Evaluación de la Educación Superior (CIEES).
Para la evaluación de los conocimientos de los egresados, se tiene la colaboración con el Centro Nacional para la Evaluación de la Educación Superior (CENEVAL). La evaluación se realiza a través de los Exámenes Generales de Egreso de Licenciatura (EGEL). La Universidad de Guadalajara participa de manera regular en las aplicaciones de los EGEL, que se llevan a cabo directamente en los Centros Universitarios, a través de las convocatorias nacionales y solicitando aplicaciones institucionales exclusivas.